空间的消毒灭菌：对于中央空调净化系统以外的洁净室，或需要灭菌的其它房间则需单独进行灭菌处理。方法是选用臭氧发生器，直接安装在该房间内。根据需要设定消毒时间，空气臭氧消毒器，消毒结束便自动关机，所以使用非常方便。
物品表面消毒灭菌：在化妆品生产过程中，常常要对原材料，工器具，恩施臭氧消毒器，包装物等进行表面消毒，常常使用消毒柜，传递窗等。传统的方法是用紫外线消毒。问题主要是在消毒不彻底，所以，若使用在诸如传递窗等要求不高的场合是可以的。但远不如臭氧的效果好。能用臭氧发生器做成的消毒柜在食品厂是深受欢迎的。只要不怕臭氧腐蚀的东西都可以放在柜内进行消毒。臭氧浓度可以设计的高一点。
为了保证制药车间，药片的质量、GMP车间环境洁净度、无菌标准，制药原水的灭菌处理，中央水循环处理，作业车间应该对生产环境中的病原微生物进行控制与检测，臭氧消毒器，检测项目包括李斯特菌，沙门氏菌，霉菌，悬浮物等病原体微生物，家用臭氧消毒器，化验室应该按照一定的计划对生产场所环境中的病原体进行检测，药片脱干处理常常脱水处理不当、细菌滋生影响微生物的滋生。工艺过程中加强检测控制容易出现病原体的环境点，达到持续改进的目的。
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