影响捍卫剂防水效果除非捍卫剂本身的性能外，捍卫方法和养护过程也是不容忽视的问题。捍卫剂使用方法不当会影响捍卫剂的防水效果;例如一般在捍卫前要求板材要清洁、干燥，如果达不到要求就会影响防水效果;要求涂刷两遍的捍卫剂如果只涂刷一遍也会影响防水的效果;有些企业将捍卫剂稀释后使用更会降低捍卫效果;要求涂刷的捍卫剂如果使用浸泡的方法，有时也会影响捍卫效果。黄金麻石材实验表明，六面完全浸泡在捍卫剂中的施工方法并不可取，这种方法使得石材内部部分微孔隙含的空气无法排出，会降低捍卫剂的渗入量，影响捍卫剂防水效果。好的方法是半面浸泡黄金麻，即表面或背面总有一个面露在捍卫剂外面，然后再浸泡另一个面。
实际工程中一般多使用表面喷涂两遍的方法，这种方法也能达到满意的效果，且施工简便，效率高。石材经捍卫后如果养护不好也会影响捍卫剂的防水效果。一般捍卫剂要求施工完成后进行1~2天的养护，在这其间能沾水，不受污染。但是实验表明，有些捍卫剂的养护期远远不止2天，有些在2天后刚开始起效，真正达到佳效果需要十几天或更长的时间。
如果在这其间接触水或污染物，仍会造成污染，影响捍卫效果。在养护期内提高环境温度一般会加速养护过程，实验室中按标准方法会对样品进行60℃烘干48h处理,在这个温度下,大部分捍卫剂会明显提高捍卫效果,有少数几个捍卫剂在105℃烘干24h后也会大幅度提高捍卫效果,究其理由是温度加速了捍卫剂的养护过程.有一些捍卫剂害黄金麻石材怕高温处理,如果在60℃时捍卫剂就会破坏的话,恐怕这种捍卫剂的应用范围会受到局限,因为外挂石材在夏天太阳照射下很容易达到这个温度.
石材护理因为不会正确使用防护剂会造成很多问题：如水斑、锈黄、泛碱、霉斑、抛光不理想、冻融等等病症，诸如此类的问题主要是因为水或液体物质污染石材造成的。天然石材是一类具有微孔结构的材料，存在着很多肉眼看不见的孔隙，这使得水和污染物很容易侵入石材，所以只要频繁接触液体物质，一定会出现上述现象。如何解决这些问题，其实很简单，那就是选好、用好石材防护剂!
上面说得是翻新中会出现的一些问题，在物业项目中我们经常也会遇到这样的情况，卫生间、茶水间的门口石材地面，使用一段时间后，会出现水斑、锈黄现象。这就是因为水的污染造成的，如果我们知道石材防护剂可以有效扼止液体对石材的侵蚀，我们在入驻时，就做好防护处理，就可能杜绝这些现象的出现，就不会面对后续的一些病症治理的问题。
那么我们如何做好防护呢?首先我们要了解石材的防护剂是有品级的，是有国家标准的产品，我们在施工中应选择经国家检测一等品以上的产品;石材防护剂有很多的分类，要了解这些分类，我们在具体工作中才能做出更好的选择和应用。比如，石材防护剂按功能分有防油型、和防水型两种，那么在进行餐厅区域石材防护处理时，我们就知道应该选择防油型防护剂，因为象餐厅这样的区域主要是油污的污染。我们在施工防护剂时还应记住12字要领：清洁、干燥、品级、足量、均匀、养生。