人工繁殖饲养泥鳅的关键在于繁殖，泥鳅自然产卵期较长，通常为每年的4~8月份，大型台湾泥鳅繁殖基地，5月下旬至6月下旬，当水温达到20℃~25℃时，是产卵盛期。用于繁殖的亲鳅要选择在2龄以上、成熟度较好、体质健壮、无病无伤的泥鳅。雌泥鳅选取体长15厘米以上、体重20克以上、腹部膨大和胸鳍宽而前端圆的个体；雄泥鳅选取长和体重略小于雌泥鳅、胸鳍狭窄而前端较尖的个体。
据了解，台湾由于对泥鳅选育及种苗繁育研究时间较长，经验较多，其泥鳅寸片的成活率可达50%-60%，而生产中也普遍达到30%左右，远高于大陆地区5%-15%左右的水平。瑞农9号表示，引进该品种后，种苗培育成活率上还须在生产中慢慢摸索。由于种苗成活率低，目前3cm左右规格的台湾泥鳅的种苗价格普遍在0.3-0.5元/尾左右。有苗场透露，待种苗培育技术提升、成活率提高后，苗价可能会逐渐下降。
瑞农9号表也认为除了种苗生产的制约，国内庞大的消费市场带动，台湾泥鳅效益分析，加上日本、韩国等国外的需求，都能支撑泥鳅养殖行业的继续发展，台湾泥鳅，泥鳅的养殖在2-3年内还是具有不错的发展空间。“如果条件允许，采取轮捕的养殖模式效益更好”。瑞农9号表建议，可适当在前期投放较高密度种苗，待泥鳅长到1两多的时候，采取分批起捕，充分利用水体达到更好收益。
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