结构是指组成翡翠的矿物结晶程度、晶体形态、颗粒大小以及矿物与矿物之间相互排列关系。翡翠是在高压背景下和高温、中温低温环境下经热液作用、接触交代作用和区域变质作用等形成的，翡翠岛，组成的矿物成分、结晶程度、晶体形态、晶粒大小和矿物彼此之间排列关系复杂多样，结构类型也干变万化。
其结构主要为：纤维状变晶结构。矿物的形态主要呈针翡翠状、纤维状和少量的长柱状。这种纤维状的矿物形态，一般形成于强大的定向侧压和中低压强的环境。矿物沿c轴单向发育。又分为：聚片双晶和解理面，如紫玉。
水头
水头是指翡翠的透明程度。水头长、水头足则透明度高，黄石翡翠，水头短、水头差则透明度低。还有一种几分水的说法，缅甸翡翠，是指用聚光电筒(点光源)来观察翡翠的透明度，并且用光线照入的深浅来衡量水头的长短，如3mm的深度为一分水，6mm的深度为二分水，9mm的深度为三分水。
种
种也称“种份”。这是一个模糊的概念，种称呼是五花八门。例如，按照透明度划分“透明度高，则种好”，翡翠，反之，则种差;透明度很好的称为“老坑种”，透明度差的称为“新种”，透明度介于两者之间的称为“新老种”;也有“玻璃种”(透明度很好)、“冰种”(透明度较好)等称呼。按矿床类型，有“老坑种”(即籽料)、“新坑种”(即山料)之分。按颜色和透明度的好坏，有“花青种”、“油青种”之分，等等。
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